В Писании не вижу, чтобы Господь устанавливал такую практику. Говорится только об отлучении конкретного человека, которого неоднократно увещевали.
Чисто логически, это несправедливо - прекратить общение с целой общиной, не удостоверившись, действительно ли каждый член виновен в грехе, из-за которого общину отлучают, и не увещевав каждого члена общины исправиться.
И чисто логически, это почти невозможно - узнать, повинен ли каждый член общины в грехе, из-за которого отлучают общину, и увещевать каждого лично.
Кстати, часто члены "отлученных" общин даже на знают, что их отлучили и почему их отлучили. Т.е. об этом могут знать только лидеры.