Как я понимаю, не факт преклонения колен имеет значение, а отношение сердца в молитве. Ибо можно преклонить колени, но не преклонить свое сердце, а можно преклонить пред Богом свое сердце, не преклоняя при этом колен (например молитва в транспорте). Мне кажется, что основное здесь именно настрой сердца.
Так же мы видим, что сам Иисус не всегда молился на коленях:
И, отойдя немного, пал на лице Свое, молился и говорил: Отче Мой! Так же и мужи веры не всегда молились на коленях:
И молился Давид Богу о младенце, и постился Давид, и, уединившись провел ночь, лежа на земле. И отворотился лицем своим к стене и молился Господу...
В некоторых общинах ЦХ, которые я знаю, некоторые христиане преклоняют колени во время молитвы. В других христиане встают. Но это остается на выбор молящегося.